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36氪首发 | 研发AI蛋白质优化与设计平台,「分子之心」完成数千万美元天使轮融资

36氪获悉,近日AI蛋白质设计平台公司「分子之心(MoleculeMind)」完成数千万美元天使轮融资,由红杉中国领投,百度风投、生命园创投基金、芯航资本、未来启创等跟投。本轮融资将用于进一步扩大团队、AI蛋白质平台的持续进化,以及科研成果的产品化转化。

分子之心由许锦波教授牵头创建,在国内组建了由计算生物专家组成的团队,团队均具备海外名校研修背景。许锦波现任美国芝加哥丰田计算技术研究所教授、北京大学BIOPIC访问教授,在“AI蛋白质折叠技术”研究上多年。其于2016年研发的RaptorX-Contact方法,首次证明深度学习可以大幅提高蛋白质结构预测的精度;2020年DeepMind将这一方法应用在AlphaFold的开发中,在破解蛋白质预测难题上贡献突出。

企业供图

基于许锦波的科研成果,分子之心继续研发“AI蛋白质预测与设计”,并自主研发了AI大分子优化与设计平台“MoleculeOS”,运用数据驱动的深度学习方法,帮助生物技术专家识别和产生蛋白质,以将实验室研究成果规模化投射到工业级应用。这一平台既可用于多肽、抗体、酶和小蛋白的研究和设计,将大分子创新药的研发变成可预测、可编程,为药物研发全流程提效;也可应用于化学、材料、工业、农业等领域蛋白质优化与设计。

“运用高通量、干湿一体化的生物计算引擎,该平台已具备蛋白质结构及特性预测、多肽和蛋白质优化能力,未来还将在成药开发、蛋白质-蛋白质相互作用的预测等方面,发挥价值。”许锦波表示,很快该平台可以设计自然界不存在的蛋白质和全新抗体。

在AI平台的基础上,分子之心正在针对特殊表位的单克隆抗体药物、小蛋白药物、双表位抗体药物等展开研究,并与国家级生命科学与医学实验室建立了合作,推动AI蛋白质研究和设计成果实现转化。

除了生物药的研发,AI大分子优化与设计平台也被运用到合成生物学,例如,制造可再生生物燃料,解决能源和环境问题;或是用AI打造新的、具有稳定功能的工业酶。

许锦波认为,虽然目前AI在蛋白质的研发方面还处于辅助地位,但有望通过学界和产业界共同的努力,让AI成为催生创新的关键驱动力。

经过近几年的研究,学界和产业界已有共识:深度学习对蛋白质结构预测的提升有显著效果,可将大部分蛋白质三维空间的大致形状预测准确。2021年AlphaFold2的Transformer模型、端到端训练的引入使得这项任务的准确性又上了一个高度。

许锦波表示,蛋白质是大自然最壮观的机器。蛋白质药物或相关制品,在治疗疾病及推动社会生产进步方面,拥有超越想象的空间。分子之心将运用AI能力,在此领域深耕,希望能在中国建立世界一流的计算生物学科,推动科技成果的产业级转化。欢迎人工智能、生物、制药等领域优秀人才加入分子之心,如有意向,可发送简历至“recruiting@moleculemind.ai”。

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